इंडियन प्रीमियर लीग में गौतम गंभीर के कप्तानी की शुरुआत 2009 में दिल्ली डेयरडेविल्स की टीम से हुई थी। साउथ अफ्रीका में खेले गए उस सीजन में उन्हें विरेंद्र सहवाग की जगह कप्तान बनाया गया था। उन्होंने टीम मैनेजमेंट के फैसले सही साबित करते हुए दिल्ली डेयरडेविल्स को सेमीफाइनल तक पहुंचाया। हालांकि उनकी लीडरशिप क्वालिटी तब ज्यादा देखने को मिली जब वो कोलकाता नाइट राइडर्स की टीम से जुड़े। गौतम गंभीर की कप्तानी में कोलकाता की टीम 2012 और 2014 के सीजन में आईपीएल की चैंपियन बनी। कप्तानी के साथ-साथ उनकी बल्लेबाजी भी इस दौरानी काफी बढ़िया रही। 2012 के संस्करण में उन्होंने 143.55 की स्ट्राइक रेट से 590 रन बनाए। टूर्नामेंट में वो दूसरे सबसे ज्यादा रन बनाने वाले बल्लेबाज रहे। आईपीएल के 9 सीजन में गौतम गंभीर अब तक 3600 से ज्यादा रन बना चुके हैं। सबसे ज्यादा रन बनाने वाले बल्लेबाजों की लिस्ट में वो चौथे नंबर पर हैं। 2014 के सीजन में बल्ले से तो वो कुछ खास नहीं कर पाए लेकिन अपनी कप्तानी से टीम को एक बार फिर से चैंपियन बनाया।