[caption id="attachment_12275" align="alignnone" width="628"] ऐसा माना जाता है कि धोनी चेन्नई के खिलाड़ियों को तरजीह देते हैं[/caption] एक और बात जिस के कारण धोनी पर उँगलियाँ उठी वो थी CSK के खिलाडियों को टीम में जगह देना। आईपीएल के शुरुआत से धोनी चेन्नई सुपरकिंग्स के कप्तान हैं और उन्होंने 2010 और 2011 में चेन्नई सुपरकिंग्स को जीत भी दिलवाई। इसमें कोई दो राय नहीं है कि आईपीएल में युवा प्रतिभा निखर के सामने आई है। युसूफ पठान, सुरेश रैना, स्टुअर्ट बिन्नी, रवि अश्विन जैसे खिलाडी आईपीएल की ही देन है। लेकिन धोनी के कप्तान होने के कारण ये आशंका जताई गयी की टीम के चयन में वे चेन्नई सुपरकिंग्स के खिलाडियों को ज्यादा महत्व देते हैं। ये भी कहा गया कि धोनी ने योग्य खिलाडी की जगह चेन्नई सुपरकिंग्स के खिलाडियों को जगह दी।