यह पाकिस्तान ऑलराउंडर क्रिकेट में विवादों का पसंदीदा खिलाड़ी रहा है। जब पाकिस्तान ऑस्ट्रेलिया के खिलाफ पांच मैचों की श्रृंखला में अपना अंतिम एकदिवसीय मुकाबला खेल रहा था, तब अफरीदी को गेंद को काटते हुए पकड़ा गया था। वह राना नावेद उल हसन के साथ चल रहे थे तब उनकी यह घटना कैमरे में कैद हो गयी। उन्होंने अंतरराष्ट्रीय क्रिकेट काउंसिल के गेंद को छेड़छाड़ करने वाले नियम का उल्लंघन किया। इन नियमों के अनुसार, 'गैरकानूनी साधनों के माध्यम से गेंद की स्थिति बदलने की कोई भी कोशिश खिलाड़ियों द्वारा संहिता का उल्लंघन है और सजा के लिए उत्तरदायी है।‘ जल्द ही मैच रेफरी रंजन मदुगले इस मामले में शामिल हुए जब मैदानी अंपायर और तीसरे अंपायर ने आपत्ति व्यक्त की और आईसीसी के नियमों का उल्लंघन करने के आरोप लगाया। नियमों के उल्लंघन के बाद अफरीदी को दो टी-20 मैच के लिए प्रतिबंधित कर दिया गया। बाद में, उन्होंने स्वीकार किया कि मैच की गर्मागर्मी के कारण उन्होंने गलती की और उसी के लिए माफी मांगी।