2009: चेन्नई सुपर किंग्स (14 मैच में 332 रन, 2 अर्धशतक)
आईपीएल का दूसरा सीजन भारत में आम चुनावों के कारण दक्षिण अफ्रीका में आयोजित किया गया। पहले सीजन की तरह दूसरे सीजन में भी धोनी अपनी कप्तानी में टीम को सेमीफाइनल तक लेकर गए। हालांकि सेमीफाइनल में उन्हें रॉयस चैलेंजर्स बैंगलोर ने हराया था।
बल्ले के साथ धोनी ने 14 मुकाबलों में 41.50 की औसत से 332 रन बनाए, जिसमें 2 अर्धशतक शामिल थे। इसके अलावा दूसरे सीजन में धोनी की स्ट्राइक रेट 127.20 की ही रही, जिसमें उन्होंने 22 चौके और 9 छक्के भी लगाए। इस बीच उनका सर्वाधिक स्कोर 58 का रहा।
2010: चेन्नई सुपर किंग्स (13 मैचों में 287 रन, 2 अर्धशतक)
आईपीएल का तीसरा सीजन धोनी के लिए काफी यादगार रहा। भले ही बल्ले के साथ वो ज्यादा योगदान नहीं द पाए थे। हालांकि अपनी कप्तानी में उन्होंने चेन्नई को पहली बार खिताबी जीत दिलाई। 2010 में हुए फाइनल मुकाबले में चेन्नई ने मुंबई इंडियंस को हराकर टूर्नामेंट जीता था।
बल्ले के साथ धोनी ने 13 मुकाबलों में 2 अर्धशतकों की मदद से 287 रन बनाए। इस बीच उनकी औसत 31.88 और स्ट्राइक रेट 136.66 रहा। धोनी ने 26 चौके और 8 छक्के भी लगाए। इस बीच उनका सर्वाधिक स्कोर 66 का रहा।