पठान शुरू में श्रीलंका दौरे के लिए टीम में नहीं थे, लेकिन बाद में घायल आर विनय कुमार के स्थान पर शामिल हुए। बड़ौदा के आलराउंडर को सभी पांच मैचों में खेलने का मौका मिला और 26.37 के औसत से 8 विकेट लेते हुए, श्रृंखला को सर्वाधिक विकेट लेने वाले खिलाड़ी के रूप में समाप्त किया। तीसरे एकदिवसीय मैच में पठान के 31 गेंद में 34 रन की मदद से भारत ने केवल दो गेंदों के रहते मैच जीता जबकि उन्होंने अंतिम एकदिवसीय मैचों में पांच विकेट लिए जिसके लिये बाद में उन्हें मैन ऑफ द मैच अवार्ड मिला। पठान विश्व ट्वेंटी -20 के दौरान भारत की टीम का नियमित हिस्सा बन गये लेकिन टूर्नामेंट के समापन पर उन्हें टीम से बाहर कर दिया गया। उन्हें चैंपियंस ट्रॉफी जीती टीम में चुना गया था लेकिन केवल एक वार्म-अप खेल पाये थे। चैंपियंस ट्रॉफी के बाद चोटों ने पठान को घरेलू सर्किट में अच्छा प्रदर्शन करने से रोका है।
हालांकि, उन्होंने 2016-17 में घरेलू सत्र में काफी अच्छा प्रदर्शन किया था, लेकिन यह राष्ट्रीय टीम में वापसी करने के लिए पर्याप्त नहीं है। भारत के पास हार्डिक पंड्या के होने और पठान के साथ उम्र नहीं होने के कारण, राष्ट्रीय टीम में इरफान पठान के लिए रास्ते का निश्चित रूप से अंत दिख रहा है।
