WWE के साथ 2 साल काम करने के बाद ब्रॉक लैसनर ने प्रोफेशनल फुटबॉल खेलने का सपना पूरा करने के लिए WWE छोड़ दी। लेकिन मिनेसोटा वाइकिंग्स के अपना सपना पूरा करने में असफल रहने के बाद लैसनर ने न्यू जापान प्रो रैसलिंग के साथ साइन कर लिया। उन्होंने IWGP हैवीवेट चैंपियनशिप के डेब्यू मैच में हुए थ्री वे बाउट में उन्होंने मसाहिरो छोनो और कैज़ुयुकी फुजिता को हराकर ख़िताब जीता। लैसनर न्यू जापान के लिए साल 2006 तक रैसलिंग करते रहे और 2006 के टोक्यो डोम शो में उन्होंने शिंसुके नाकामुरा के खिलाफ सफलतापूर्वक अपना ख़िताब बचाया। लेकिन फिर पैमेंट के किसी विवाद के चलते लैसनर ने न्यू जापान प्रो रैसलिंग छोड़ दी, इसके साथ ही उन्हें ख़िताब भी छोड़ना पड़ा। इसके बाद ब्रॉक MMA में अपना करियर बनाने चले गए।
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